Настройте фильтры LVM на хосте. Для этого необходимо прописать в /etc/lvm/lvm.conf фильтр, разрешающий активацию только LV ОС хоста. Например, если системные LV размещены на Volume Group на /dev/sda2, то фильтр будет следующим:
filter = [ "a|^/dev/sda2$|", "r|.*|" ]